наукоследЧто искать для своей задачи
Свяжите термин с организмом или типом клеток, если нужен конкретный эксперимент.
- gene regulatory network — сеть регуляции генов.
- metabolic network — сеть метаболических реакций.
- cell cell communication — взаимодействие клеток через сигналы.
- multi omics integration — совместный анализ разных типов молекулярных данных.
- flux balance analysis — метод анализа потоков в метаболической сети.
Как найти методы и примеры применения
Для общей темы на bioRxiv выберите Systems Biology. В eLife есть направление Computational and Systems Biology; Europe PMC поможет найти журнальные работы и обзоры.
Если вам нужна реконструкция сети, начните с gene regulatory network inference. Для метаболического моделирования попробуйте flux balance analysis. Эти запросы дадут более прикладные результаты, чем общее systems biology.
Как получать новые исследования
В боте: «Добавить тему» → bioRxiv → «Ключевая фраза» → gene regulatory network → «Подтвердить». Для всей области выберите «Категория» → Systems Biology.
В статье о новой вычислительной модели найдите входные данные и проверочный пример: какие измерения подаются в метод и что он выдаёт. Если хотите повторить анализ, ищите ссылку на код и набор данных. Для биологического вывода найдите эксперимент, которым авторы проверяли предсказание сети.
Английские термины для поиска
- gene regulatory network
- сеть регуляции активности генов
- metabolic network
- сеть химических реакций обмена веществ
- multi omics integration
- совместный анализ нескольких типов молекулярных данных
- flux balance analysis
- анализ распределения потоков в метаболической сети
Готовые примеры для бота
systems biologycomputational-systems-biologygene regulatory networkНажмите «Настроить подписку в Telegram», выберите подходящий пример и подтвердите его в боте.
Частые вопросы
Чем эта тема отличается от биоинформатики?
В системной биологии главный вопрос — устройство и поведение биологической системы. В биоинформатике можно искать методы обработки данных независимо от конкретной системы.